Lighting設定をスクリプトから設定したい場合はRenderSettingsを使うと良いそうです。
例えば、Ambient Intensityを設定する場合は次のような感じです。

RenderSettings.ambientIntensity = 2.0f;

リンク

Unity – Scripting API: RenderSettings
https://docs.unity3d.com/ScriptReference/RenderSettings.html

Access Lighting window properties in Script ? – Unity Forum
https://forum.unity.com/threads/access-lighting-window-properties-in-script.328342/